Негова основна цел е грижата за железопътната инфраструктура на страната, като за целта между предприятието и държавата биват сключвани дългосрочни договори.
ДП НКЖИ базира дейността си на проучвания, прогнози и програми за развитие на железопътната инфраструктура в съответствие с подписаните договори.